想必大家在學(xué)習(xí)高中化學(xué)的時(shí)候經(jīng)常做關(guān)于化學(xué)鍵相關(guān)的試題，而化學(xué)反應(yīng)的實(shí)質(zhì)就是化學(xué)鍵的形成和斷裂。學(xué)術(shù)界一直對(duì)化學(xué)鍵的美妙形成過程頗感興趣，但是如何能實(shí)時(shí)“看見”這一過程就顯得尤為困難。
事實(shí)上，學(xué)者們一直在通過各種手段對(duì)化學(xué)鍵合過程進(jìn)行監(jiān)測(cè)，例如通過理論計(jì)算等對(duì)化學(xué)鍵合進(jìn)行預(yù)測(cè)，然而理論計(jì)算僅僅是在理想情況下對(duì)化學(xué)反應(yīng)過程進(jìn)行模擬預(yù)測(cè)，與實(shí)際反應(yīng)過程存在一定差異。因此，我們?cè)鯓硬拍軐?shí)時(shí)觀測(cè)到化學(xué)鍵合這一精妙的過程呢？
近日，來自韓國(guó)先進(jìn)科學(xué)技術(shù)院的Ihee教授團(tuán)隊(duì)和他們的國(guó)際合作者利用飛秒X射線技術(shù)成功地捕捉到了金三聚體中化學(xué)鍵形成的持續(xù)反應(yīng)過程。并且，該研究突破了先前的認(rèn)識(shí)，即在兩個(gè)不同的階段同時(shí)發(fā)生即使在化學(xué)鍵合完成后，金三聚體原子中的原子仍保持運(yùn)動(dòng)。原子間的距離周期性地增加和減少，表現(xiàn)出分子振動(dòng)。該研究以題為“Mapping the?emergence of molecular vibrations mediating bond formation”發(fā)表在國(guó)際頂級(jí)期刊《Nature》上。
該研究的作者Kim?Jong Goo?博士表示“他們將推動(dòng)這種利用飛秒x射線散射實(shí)時(shí)跟蹤分子和分子振動(dòng)中的原子位置的方法，揭示人體內(nèi)有機(jī)和無機(jī)催化反應(yīng)以及涉及蛋白質(zhì)的反應(yīng)機(jī)理。通過在反應(yīng)過程中直接跟蹤分子振動(dòng)和分子中所有原子的實(shí)時(shí)位置，我們將能夠揭示各種未知的有機(jī)和無機(jī)催化機(jī)理。”
【為什么別人家發(fā)表出來的是Nature】
化學(xué)反應(yīng)的基礎(chǔ)研究通?？紤]分子動(dòng)力學(xué)沿著計(jì)算的勢(shì)能面進(jìn)行，但是以時(shí)間分辨的方式跟蹤所有的核運(yùn)動(dòng)，在實(shí)驗(yàn)上完全描繪出這樣的動(dòng)力學(xué)具有極大的挑戰(zhàn)性，甚至對(duì)于簡(jiǎn)單的定型雙分子反應(yīng):A–B+C→A+B–C都尚未實(shí)現(xiàn)。本文以[Au(CN)2-]3配合物作為模型體系，紫外光照射使[Au(CN)2-]3從基態(tài)(S0)激發(fā)到單重態(tài)(S1)，在20fs內(nèi)達(dá)到三重態(tài)激發(fā)態(tài)(T′1)。然后，在時(shí)間常數(shù)約為1-2ps的情況下，從T′1進(jìn)一步轉(zhuǎn)變?yōu)榱硪粋€(gè)三重態(tài)激發(fā)態(tài)(T1)，完成共價(jià)鍵的形成和絡(luò)合物從彎曲到線性結(jié)構(gòu)的轉(zhuǎn)變。鍵的形成可能涉及圖1b所示的三個(gè)可能的候選軌跡中的任何一個(gè)?；鶓B(tài)的平衡結(jié)構(gòu)決定了激發(fā)態(tài)中Franck–Condon (FC)區(qū)域的位置。
在FC區(qū)產(chǎn)生的激發(fā)態(tài)波包可以看作是反應(yīng)的反應(yīng)物(A+B+C)。利用三維極坐標(biāo)RAB、RBC和RAC，如果FC區(qū)位于RAB短于RBC的點(diǎn)，連接FC區(qū)與T′1平衡結(jié)構(gòu)的最短路徑為路徑2，對(duì)應(yīng)于協(xié)同鍵的形成?；蛘?，兩個(gè)共價(jià)鍵可以路徑1和3按時(shí)間順序形成，它們的區(qū)別只是共價(jià)鍵的形成順序：路徑1表示首先形成A和B之間的共價(jià)鍵的路徑，路徑3表示首先形成B和C之間的鍵的情況(圖1c)。但是如何確定FC區(qū)域內(nèi)的反應(yīng)軌跡非常困難。而飛秒電子、X射線散射和X射線吸收光譜既具有結(jié)構(gòu)靈敏度，又具有實(shí)時(shí)探測(cè)分子結(jié)構(gòu)超快變化所需的時(shí)間分辨率，它們被用來觀察振動(dòng)運(yùn)動(dòng)。
【飛秒X射線技術(shù)大放光彩】
作者用時(shí)間分辨X射線液相圖對(duì)實(shí)驗(yàn)進(jìn)行分析，圖2提供了與時(shí)間依賴的分子結(jié)構(gòu)信息，并最終能夠在多維核坐標(biāo)系中追蹤波包的運(yùn)動(dòng)。通過對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)一步分析，發(fā)現(xiàn)波包的運(yùn)動(dòng)軌跡在兩個(gè)不同的時(shí)間范圍內(nèi)出現(xiàn)：(1)T′1的PES在早期從S1的FC區(qū)域開始的初始運(yùn)動(dòng)(T<360fs);?(2)隨后在T′1的平衡結(jié)構(gòu)周圍的諧波振蕩(T>360fs)。在早期，激發(fā)態(tài)和基態(tài)波包各自在各自的PES上移動(dòng)，以接近各自的平衡結(jié)構(gòu)。
為了研究成鍵機(jī)理，作者首先考察了激發(fā)態(tài)波包相對(duì)于共價(jià)鍵形成過程和彎曲到線性轉(zhuǎn)變的初始運(yùn)動(dòng)。具體地說，如圖3a所示，在FC區(qū)域(RAB=3.13?，RBC=3.38?，θ=119°)中產(chǎn)生激發(fā)態(tài)波包，然后在T′1的PES上向T′1的平衡結(jié)構(gòu)移動(dòng)(RAB=2.82?，RBC=2.82?，θ=180°)。沿θ坐標(biāo)，T′1中的激發(fā)態(tài)波包從FC區(qū)開始(θ=119°)，在335fs內(nèi)達(dá)到T′1的平衡(θ=180°)，給出了彎曲到線性變換的時(shí)間尺度。激發(fā)態(tài)波包的軌跡表明，兩個(gè)共價(jià)鍵的形成不是在一個(gè)協(xié)同的過程中發(fā)生。相反，RAB在35fs延遲下迅速下降到T′1 (2.82?)平衡的共價(jià)Au–Au鍵長(zhǎng)度，在60fs時(shí)，RAB變得更短，達(dá)到整個(gè)軌道的最小長(zhǎng)度。但是此時(shí)和第三個(gè)Au之間的距離高于Au-Au共價(jià)鍵長(zhǎng)度，因此第三個(gè)Au通過調(diào)節(jié)角度進(jìn)一步靠近Au-Au鍵，并在360 fs達(dá)到成鍵的距離，形成Au-Au-Au化學(xué)鍵合狀態(tài)。對(duì)360 fs后的三聚體[Au(CN)2?]3動(dòng)力學(xué)過程進(jìn)行分析。在形成了三聚體后的360 fs后分子在平衡位置附近進(jìn)行諧波振蕩運(yùn)動(dòng)。
【整體成鍵過程】
在0 fs對(duì)樣品進(jìn)行紫外光激發(fā)，此時(shí)處于基態(tài)S0的三個(gè)分子[Au(CN)2–]3中Au通過較弱的電子親和力進(jìn)行相互作用，分子間形成彎曲的結(jié)構(gòu)。在光激發(fā)后，分子由S0基態(tài)迅速變?yōu)镾1激發(fā)態(tài)，同時(shí)分子間的Au彼此形成共價(jià)鍵，分子間的結(jié)構(gòu)由彎曲狀態(tài)變?yōu)榫€性結(jié)構(gòu)。隨后在大約1.6 ps，S1態(tài)轉(zhuǎn)變?yōu)槿貞B(tài)T1，并且Au之間的鍵長(zhǎng)縮短0.1 ?。在反應(yīng)進(jìn)行到ns尺度，這種三聚體[Au(CN)2–]3分子轉(zhuǎn)變?yōu)樗木垠w[Au(CN)2–]4。最終，四聚體Au離子恢復(fù)到最初狀態(tài)。
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【小結(jié)】
這項(xiàng)研究創(chuàng)造性的通過飛秒X射線散射直接觀測(cè)光催化Au(CN)2?聚合反應(yīng)中化學(xué)鍵生成過程，探索了Au(CN)2?三分子聚合反應(yīng)中兩個(gè)Au-Au形成的過程，有望應(yīng)用于追蹤各種有機(jī)/無機(jī)化學(xué)反應(yīng)，以及人體內(nèi)的生物反應(yīng)，并揭示未知反應(yīng)的內(nèi)在形成機(jī)理。
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